مرجان اتفاقیان بازیگری را بدون زمینه قبلی در سال ۱۳۹۴ و با حضور در کلاسهای بازیگری «هومن سیدی» شروع کرد. در سال ۱۳۹۶ در تئاتر و خداوند، هایم را فراموش کرده است به کارگردانی «هامون سیدی» به ایفای نقش پرداخت و پس از آن در همان سال با دعوت هومن سیدی اولین تجربه سینمایی را با بازی در فیلم سینمایی مغزهای کوچک زنگ زده به کارگردانی هومن سیدی به دست آورد.
وی در آن فیلم نقش شهره را بازی کرد و توانست در بیست و یکمین جشن سینمای ایران نامزد بهترین بازیگر نقش اول زن شود. پس از آن در سریال سیاوش به ایفای نقش پرداخت. او در این سریال نقش مرجان نامزد سیاوش ساقی با بازی (میلاد کیمرام) را بازی کرده است.