علی شمخانی، در گفت وگویی تلویزیونی درباره حادثه هواپیمای اوکراینی مدعی شد: بعد از وقوع حادثه هواپیمای اوکراینی، سردار باقری با من تماس گرفتند و بلافاصله موضوع را به رئیسجمهور وقت، آقای روحانی، اطلاع دادم. وظیفهای نداشتم که این خبر را به آقای ظریف اعلام کنم.
حالا محمئ واعظی، رئیس دفتر روحانی، در واکنش به ادعای شمخانی، گفت: صبح پنج شنبه، بعد از جلسه دبیرخانه شورای امنیت ملی، معاون شمخانی از ظریف میخواهد که چیزی را اعلام کند؛ ظریف میگوید من هیچ چیزی نمیدانم، چه چیزی را اعلام کنم. ظریف به شمخانی میگوید در بیرون گفته شده به هواپیما شلیک شده، که شمخانی میگوید این را هم داریم بررسی میکنیم. اینجا شک شان بیشتر شد. ساعت ۲ و نیم عصر، ظریف یا اسلامی با من تماس گرفتند که اینها دارند این عامل را هم بررسی میکنند. من زنگ زدم به روحانی گفتم؛ روحانی بلافاصله جلسه شورای امنیت ملی را بعد از نماز مغرب تشکیل دادند. در جلسه، روحانی به قطعیت رسید که [هواپیما زده شده]و اصرار میکند که باید امشب به مردم اعلام شود.
وی افزود: در جلسه مخالفت وجود داشته که ما به قطعیت نرسیدم؛ روحانی میگوید تمام رسانهها چیز دیگری میگویند، شما چیز دیگری میگویید؛ محکم بگویید هست یا نیست. بعد از جلسه توافق میکنند که بیانیه بدهند؛ روحانی هر چه صبر میکند میبیند بیانیه اعلام نمیشود، بالاخره شنبه اعلام شد. اگر آن جلسه با آن فشار تشکیل نمیشد، ممکن بود چیزهای دیگر رخ دهد.