خاتمی که در حاشیه بازدید از موزه ملی قرآن کریم و در جمع خبرنگاران سخن می گفت، در خصوص لغو مصوبه دولت وی درباره امکان مامور شدن کارکنان دولت به دو موسسه "گفت و گوی تمدن ها و بنیاد باران" از سوی دولت جدید، گفت: دولت جدید حق دارد هر تصمیمی بگیرد و تصمیماتی که دولت می گیرد، برای همه قابل احترام است.
وی افزود: این مصوبه ای بود که بیش از 8 سازمان و نهاد رسمی ثبت شده از جمله دانشگاه امام صادق (ع) را مشمول شرایطی کرده بود که افراد می توانستند بدون دریافت حقوق از دولت، حقوق و مزایای خود را از موسسه مربوطه دریافت کنند، اما در عین حال سابقه فعالیت دولتی آنها محفوظ بماند.
خاتمی خاطر نشان کرد: این مصوبه برای ما که می خواهیم دولت را کوچک کنیم می تواند مفید باشد، زیرا کارمندان می توانند ضمن حفظ سابقه خود، حقوق و مزایایشان را از موسسه مربوطه دریافت کنند و مساله مربوط به همین قسمت بود که چند بنیاد شامل این مساله می شدند.
رییس جمهور سابق تاکید کرد: به هر حال یک دولت تصمیمی می گیرد و دولتی دیگر آن را لغو می کند و این حق مسلم یک دولت است و مساله مهمی نبوده است.
وی از "بنیاد باران" به عنوان مرکزی یاد کرد که متشکل از مدیرانی است که می خواهند کارهای علمی و فنی انجام دهند، و اضافه کرد: درباره این موسسات چون می خواهم روی پای خود بایستم، کارها به کندی پیش می رود و امیدواریم که به زودی امکانات فراهم و کار دنبال شود.
خاتمی در خصوص اینکه آیا احمدی نژاد با او مشورت می کند یا خیر، اظهار داشت: در ابتدای کار دولت جدید طی دو دیداری که با هم داشتیم به طور مفصل در این زمینه صحبت کردیم و مطالبی را که به نظرمان می رسید عنوان کردیم . آقای احمدی نژاد مطالب خوبی داشتند که بیان کردند، اما پس از انتقال دولت توفیق نداشتم تا با ایشان ملاقاتی داشته باشم.
وی افزود: هر دولتی در آغاز کار معمولا با مشکلات فراوانی رو به رو است، تشکیل دولت و وزارتخانهها بسیار وقت گیر است و من به دوستان حق می دهم که ذهنشان متمرکز شکل دهی کار دولت شده باشد.
خاتمی در ادامه گفت و گوی خود با خبرنگاران، از پاسخ دادن به سوال خبرنگاری که درباره اظهارات اخیر احمدی نژاد مبنی بر محو رژیم صهیونیستی و واکنش های جهان غرب، خودداری کرد.
خبرنگاری از رییس جمهور سابق کشورمان در خصوص لغو سفر خارجی اش سوال کرد و خاتمی پاسخ داد: چنین چیزی صحت ندارد.
وی ادامه داد: تمام سفرهای خود را طبق برنامه پیش بینی شده انجام می دهم و در اولین مرحله طبق دعوتهای فراوانی که دارم به دعوت "رایسیگر" رییس جمهور اسبق آلمان برای شرکت در یک نشست به برلین خواهم رفت و سپس در مجلسی در هامبورگ سخنرانی خواهم کرد.
خاتمی تصریح کرد: در ادامه سفرهای خارجی خود برای شرکت در جلسه گروه 18 نفره ای که آقای کوفی عنان تشکیل داده اند به اسپانیا خواهم رفت و در ادامه به لبنان می روم و به احتمال زیاد در اوایل سال میلادی آینده در سفری به مالزی در سمینار بسیار بزرگی شرکت و در همایشی به نام "چه کسی از طرف اسلام سخن خواهد گفت" سخنرانی خواهم کرد.
وی متذکر شد: تمام زمینه ها برای من مهیا است و بر اساس آنچه که خود خواستم و پذیرفتم به این سفرها جواب مثبت خواهم داد.
رییس جمهوری سابق در خصوص تشکیل مجمع جهانی گفت و گوی تمدنها نیز یاد آورشد: مرکز گفت و گوی تمدن ها در ایران که همان موسسه دولتی گفت و گوی تمدن هاست، از این پس در قالب یک تشکل غیر دولتی اداره می شود و تلاش می کنم با عالم اسلام و نمایندگی کردن تفکرهای نوی جهان اسلام با دنیا تعامل کنیم.
خاتمی در خاتمه افزود: مجمعی نیز در خارج از کشور تشکیل خواهد شد که افراد و شخصیت های معتبر در عرصه بین المللی در آن به گفت و گو خواهند نشست و در واقع گفت و گویی میان شرق و غرب، اسلام و مسیحیت و سایر ادیان و فرهنگ ها خواهد بود.