این خلیج، چند سالی میشود که به دلایل مختلف از جمله دخالتهای انسانی رو به خشکی است و به یکی از بحرانهای زیست محیطی استان گلستان بدل گشتهاست؛ خلیج گرگان دارای کانالی است که اگر با در نظر گرفتن اقتضائات زیستمحیطی لایروبی شود، آب از دریا وارد آن خواهد شد و بار دیگر حیات به خلیج گرگان بازخواهد گشت.