همایون شجریان در ۳۱ اردیبهشت ۱۳۵۴ در تهران در خانوادهای اهل موسیقی متولد شد. همایون شجریان برادر کوچک مژگان شجریان است. همایون شجریان در سال ۱۳۷۵ با گیتا خوانساری ازدواج کرد که حاصل این ازدواج فرزندی به نام یاسمین است. همایون شجریان از کودکی به موسیقی علاقهمند بود تا آنکه با راهنمایی پدرش برای فراگیری تکنیک و شناخت ریتم زیر نظر ناصر فرهنگفر آموزش دید. همایون شجریان در همان زمان به هنرستان موسیقی رفت و کمانچه را به عنوان ساز تخصصی خود انتخاب کرد.
کنسرت همایون شجریان که با استقبال گسترده ایرانیان مقیم استرالیا در سالنی در ملبورن در حال اجرا بود، با حمله گروهک تروریستی منافقین ناتمام ماند.
همایون شجریان که با پخش تصویری از مهسا امینی mahsa amini، به اجرای قطعات موسیقی پرداخته بود در میانه اجرا و با اغتشاش و فحاشی تعدادی از منافقین حاضر در سالن و بیرون سالن اجرا، اجرای خود را متوقف کرد و با عذرخواهی از مردم سالن را ترک کرد.