طرح مطالعاتی استراتژی توسعه صنعتی که توسط آقای نیلی و همکاران وی تهیه شده و تاکنون حدود یک میلیارد تومان هزینه داشته، از سوی بسیاری از کارشناسان صنعتی کشور مورد انتقاد قرار گرفته و حتی برخی از مقامات وزارتخانه، ضعف ها و کم حاصلی آن را مورد تایید قرار داده اند.