این غار در ارتفاع ۱۹۰۰ متر از سطح دریا واقع شده است. سقف غار که در برخی قسمتها تا ۱۰ متر از سطح آب ارتفاع دارد، پوشیده از رسوبات کربنات کلسیم خالص و مخلوط با عناصر شیمیایی دیگر است. این رسوبات استلاگمیتهایی با فرمهای جذاب ایجاد کردهاند و در کف غار و جاهایی که آب وجود ندارد، نیز استلاگمیتها منظره زیبایی بوجود آوردهاند.
منشأ آب غار چشمههای زیرزمینی و علاوهبر آن، ریزشهای جوی است که به صورت قطرات آب از دیوارهها و سقف غار به درون آب میریزد. در کل این غار عظیم از طریق فرسایش و ایجاد حفرههای ریز در توده سنگهای آهکی و بههم پیوستن تدریجی این حفرهها در طی سالیان طولانی ایجاد شده است. غار علیصدر که بزرگترین غار آبی جهان بهشمار میرود، در ۱۵ دی ۱۳۸۷ در فهرست میراث طبیعی ایران به ثبت رسید.