با توجه به تغییرات اقلیمی و گرم شدن کره زمین تالاب های زیادی ازبین رفته اند و تالاب میانکاله نیز از این تغییرات زیان دیده است؛ پس از حضور رییس جمهور در اسفند ماه ۱۴۰۰ در خلیج گرگان، دستور فوری آغاز لایروبی و رسوب برداری از کانال های سه گانه منطقه صادر و پس از مدت کوتاهی با هماهنگی سازمان بنادر و دریانوردی به عنوان مجری و قرارگاه سازندگی خاتم الانبیا به عنوان پیمانکار ، مرحله نخست این عملیات آغاز شده و امید است سبب احیای تالاب میانکاله و بازگشت پرندگان مهاجر شود.
تصفیه فاضلاب شهرهای بالادست و شهرکهای صنعتی حاشیه خلیج و دادن حق آبه تالاب و یا جایگزین کردن آبهای برداشت شده در بالادست از سایر حوزهها از جمله پیشنهادات دیگر برای احیای این منطقه ارزشمند است.