روابط عمومی «موسسه اندیشه شهید آوینی» پیرو طرح برخی شبهات درباره انتصاب این مجموعه به شهید آوینی، توضیحاتی ارائه کرد.
در متن این توضیحات آمده است: استفاده از نام شهدا برای عنوان مؤسسات فرهنگی و مراکز و نهادهای مرتبط، روش پسندیدهای است که حمایت قانون و عرف را به همراه داشته است.
از جمله این مراکز، «مؤسسه فرهنگی شهید آوینی» است که قریب به ٢٠ سال سابقه دارد.
از آنجایی که خانواده معزز شهید آوینی قصد ثبت مؤسسه فرهنگی به نام شهید آوینی را داشت و متعاقب پیگیریهای به عمل آمده، این امکان فراهم شد و «مؤسسه فرهنگی شهید آوینی» به «مؤسسه اندیشه شهید آوینی» تغییر نام یافت.
پس از تغییر نام رسمی مؤسسه، که تاحدودی با تغییر مدیرعامل و مدیریت مؤسسه نیز همراه شد، همه اقدامات با استفاده از عنوان جدید صورت گرفته است.
لازم به ذکر است در تیتراژ سریال گاندو (از آخرین فعالیتهای رسانهای این مؤسسه) که از شبکه سوم سیما پخش شده، عنوان «مؤسسه اندیشه شهید آوینی» در ابتدا و انتهای تیتراژ سریال به کار رفته است.