انتقال بابک مرادی به استقلال، موضوعی است که مورد اعتراض باشگاه ماشین سازی قرار گرفته چرا که این باشگاه تبریزی معتقد است بابک مرادی هنوز بازیکن ماشین سازی است و مجاز به فسخ یکطرفه قرارداد نیست.
به همین خاطر ماشین سازی اعتراض خودش را به همراه مستندات لازم، پس از اینکه مرادی قراردادش را فسخ کرده بود از طریق وکیل باشگاه به کمیته تعیین وضعیت بازیکنان فدراسیون فوتبال ارائه داده است.
شکایت ماشین سازی در کمیته تعیین وضعیت فدراسیون فوتبال بررسی شده و این کمیته از بابک مرادی نیز مستندات لازم را خواسته تا تصمیمات لازم را در خصوص این پرونده اتخاذ کند.