آسیبهای وارد شده به این مدرسه تاریخی که یکی از حافظههای جمعی مردم اصفهان محسوب میشود، تا جایی است که آسیبهایی که به مرور به این فضای آموزشی تاریخی وارد شد، باعث شد تا در سال ۱۳۹۲ قسمت میانی مدرسه بهصورت کامل تخریب شود، شیروانی سقفهای بخش جنوبی ویران و بارندگیها به مرور باعث ریزش سقف شود، همچنین برخی از معتادان و بیخانمانها دیوارهای بخش شرقی این مدرسه را تخریب کنند و راه ورودی به کلاسها را برای اسکان موقت ببندند. هر چند این مدرسه با نام «مدرسه اتحاد» در بهمن سال ۱۳۹۳ به ثبت ملی رسید، اما از اوایل دهه ۸۰ شمسی قسمت شرقی مدرسه به دلیل نا ایمن بودن تخلیه شد و سرانجام از سال ۱۳۹۷ تاکنون مدرسه به صورت کامل تعطیل و به حال خود رها شده است.