پژوهشها نشان داده اند که گوجه فرنگی پخته مانند سس گوجه فرنگی پخته بیشتر از گوجه فرنگی خام باعث افزایش یک نوع باکتری مفید برای بدن به نام Lactobacillus reuteri و فعالیت آن در روده میشود. همچنین، پختن گوجه فرنگی باعث میشود که lycopene بیشتری از آن در مقایسه با گوجه فرنگی خام در روده جذب بدن شود.